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--- calcoloscientifico:folding_unipr [02/04/2020 09:59] – roberto.alfieri
+++ calcoloscientifico:folding_unipr [08/04/2020 10:22] (versione attuale) – roberto.alfieri
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-=== folding@unipr ===
-L’Università di Parma dono ore di calcolo al progetto folding@home per capire come funzionano le proteine del virus e quindi  progettare terapie per fermarle.
+=== L’Università di Parma dona ore di calcolo del proprio Data Center HPC  al progetto Folding@home per capire come funzionano le proteine del Coronavirus e quindi  progettare terapie per fermarle. ===
+Le proteine sono costituite da una catena lineare di sostanze chimiche chiamate amminoacidi che, in molti casi, si "piegano" (fold) spontaneamente in strutture compatte e funzionali. È il modo in cui i componenti di una proteina sono disposti e spostati che determinano la funzione della proteina. I virus hanno proteine che usano per sopprimere il nostro sistema immunitario e riprodursi.
+Il modo di ripiegarsi delle proteine può essere simulato al calcolatore, ma la simulazione richiede un tempo di calcolo enorme ed è per questo che il progetto Folding@home (https://foldingathome.org) utilizza  la potenza di calcolo inutilizzata di migliaia di PC di proprietà di volontari, che hanno deciso di installare e di eseguire un apposito software sul proprio computer.
-Le proteine sono costituite da una catena lineare di sostanze chimiche chiamate amminoacidi che, in molti casi, si "piegano" (fold) spontaneamente in strutture compatte e funzionali. E’ il modo in cui i componenti di una proteina sono disposti e spostati che determinano la funzione della proteina. I virus hanno proteine che usano per sopprimere il nostro sistema immunitario e riprodursi.
-Il modo di ripiegarsi delle proteine può essere simulato al calcolatore, ma la simulazione richiede un tempo di calcolo enorme ed è per questo che il progetto folding@home ( https://foldingathome.org/ ) utilizza  la potenza di calcolo inutilizzata di migliaia di PC di proprietà di volontari, che hanno deciso di installare e di eseguire un apposito software sul proprio computer.
+Il progetto Folding@home, nato negli Stati Uniti è costituito da un gruppo di laboratori di ricerca sparsi nel mondo che, utilizzando una serie di software che vengono implementati ad hoc, studia la comprensione dei meccanismi biochimici attraverso i quali si sviluppano certe patologie. In questo momento particolare il focus è appunto sullo studio dei meccanismi del Coronavirus.
+Negli ultimi giorni le installazioni hanno superato quota 400.000, per una potenza di calcolo complessiva di circa 474 PetaFLOPs, decisamente superiore al più potente calcolatore al mondo, che arriva a 150 PetaFLOPs (http://top500.org).
+L’Ateneo di Parma dispone di un Supercomputer per il calcolo ad alte prestazioni (HPC) a supporto della ricerca scientifica, gestito dalla U.O. Erogazione Servizi dei Sistemi Informativi (https://www.hpc.unipr.it).
-Negli ultimi giorni le installazioni  hanno superato quota 400.000, per una potenza di calcolo complessiva di circa 474 PetaFLOPs, decisamente superiore al piu’ potente calcolatore al mondo che arriva a 150 PetaFlops (http://top500.org).
+Da diversi giorni, 5 nodi del cluster HPC, per un totale di circa 300 core e 8 GPU, stanno contribuendo al progetto.
-L’Ateneo di Parma dispone di Supercomputer a supporto della ricerca scientifica ( https://www.hpc.unipr.it ) e da diversi giorni 8 nodi del calcolatore, per un totale di circa 300 core e 8 GPU, stanno contribuendo al progetto.
 Parma, 1/4/2020