#!/bin/bash
#SBATCH --job-name=bactgen
#SBATCH --output=%x.o%j
#SBATCH --error=%x.e%j
#SBATCH --nodes=1
#SBATCH --ntasks-per-node=1
#SBATCH --cpus-per-task=4
#SBATCH --time=0-01:00:00
#SBATCH --mem=8G
#SBATCH --partition=cpu
#SBATCH --qos=cpu
#SBATCH --account=<account>

module load apptainer
module load bactgen

apptainer run "$CONTAINER" micromamba list
echo '─────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────'
apptainer run "$CONTAINER" tormes --help
echo '─────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────'