| Entrambe le parti precedenti la revisioneRevisione precedenteProssima revisione | Revisione precedente |
| calcoloscientifico:softwareapplicativonew1:chem [26/06/2019 11:50] – fausto.pagani | calcoloscientifico:softwareapplicativonew1:chem [29/05/2023 17:43] (versione attuale) – federico.prost |
|---|
| ^ Name ^ Version ^ Installation ^ Module ^ note ^ | ^ Name ^ Version ^ Installation ^ Module ^ note ^ |
| ^ APPLICATIONS / TOOLS ^^^^^ | ^ APPLICATIONS / TOOLS ||||| |
| | [[..:priv:cluster:softwareapplicativo:Crystal14 ]] | 1.04 | /hpc/share | crystal14/1.0.4 (todo) | | | [[..:priv:cluster:softwareapplicativo:IQmol]] | 3.1.2 | apptainer | iqmol-3.1.2 | http://iqmol.org/index.html | |
| | [[..:priv:cluster:softwareapplicativo:QE]] | 5.4.0 | rpm | no | http://www.quantum-espresso.org/ | | | [[..:priv:cluster:softwareapplicativo:Q-Chem]] | 6.0 | /hpc/share | qchem/6.0 | https://www.q-chem.com/ | |
| | [[..:priv:cluster:softwareapplicativo:Gromacs ]] | 4.5.7, 5.1.4 | /hpc/share | no | http://www.gromacs.org/ | | | [[..:priv:cluster:softwareapplicativo:Crystal14]] | 1.04 | /hpc/share | crystal14/1.0.4 (todo) | | |
| | [[..:priv:cluster:softwareapplicativo:Gaussian ]] | 09, 16 | module| | http://gaussian.com/ | | | [[..:priv:cluster:softwareapplicativo:XCrySDen]] | 1.6.2 | apptainer | xcrysden/1.6.2 | http://www.xcrysden.org | |
| | [[..:priv:cluster:softwareapplicativo:gv ]] | 6 | module | | Gaussview 6 | | | [[..:priv:cluster:softwareapplicativo:QE]] | 7.1 | module | qe/7.1 | https://www.quantum-espresso.org/ | |
| | [[..:priv:cluster:softwareapplicativo:Amber ]] | 11 | /hpc/share | | http://ambermd.org/ | | | [[..:priv:cluster:softwareapplicativo:Gromacs]] | 4.5.7, 5.1.4 | /hpc/share | no | http://www.gromacs.org/ | |
| | [[..:priv:cluster:softwareapplicativo:Schrodinger ]] | 2017 | /hpc/share | | | | | [[..:priv:cluster:softwareapplicativo:Gaussian]] | 09, 16 | module | | http://gaussian.com/ | |
| | [[..:priv:cluster:softwareapplicativo:AutoDock ]] | 4.2.6 | /hpc/share | | | | [[..:cluster:softwareapplicativo:gv]] | 6.1.1 | module | | Gaussview 6 | |
| | [[.:priv:cluster:softwareapplicativo: qiime ]] | | virtualenv | | http://qiime.org/ | | | [[..:priv:cluster:softwareapplicativo:Amber]] | 11 | /hpc/share | | http://ambermd.org/ | |
| | [[.:priv:cluster:softwareapplicativo: flash ]] | | module | | | | | [[..:priv:cluster:softwareapplicativo:Schrodinger]] | 2017 | /hpc/share | | | |
| | [[.:priv:cluster:softwareapplicativo: prinseq ]] | | module | | | | | [[..:priv:cluster:softwareapplicativo:AutoDock]] | 4.2.6 | /hpc/share | | | |
| | [[..:priv:cluster:softwareapplicativo: espresso md ]] | | virtualenv | | http://espressomd.org/wordpress/| | | [[.:priv:cluster:softwareapplicativo: qiime]] | | virtualenv | | http://qiime.org/ | |
| | [[..:priv:cluster:softwareapplicativo: namd ]] | | module | | http://www.ks.uiuc.edu/Research/namd/| | | [[.:priv:cluster:softwareapplicativo: flash]] | | module | | | |
| | [[..:priv:cluster:softwareapplicativo: plumed ]] | | module | | http://www.plumed.org/| | | [[.:priv:cluster:softwareapplicativo: prinseq]] | | module | | | |
| | [[.:priv:cluster:softwareapplicativo: mpi4py ]] | | rpm ohpc | | | | | [[..:priv:cluster:softwareapplicativo: espresso md]] | | virtualenv | | http://espressomd.org/wordpress/ | |
| | [[..:priv:cluster:softwareapplicativo:orca ]] | 4.1.1 | /hpc/share | moduledeps/gnu7-openmpi3/orca | https://orcaforum.kofo.mpg.de | | | [[..:priv:cluster:softwareapplicativo: namd]] | | module | | http://www.ks.uiuc.edu/Research/namd/ | |
| | [[..:priv:cluster:softwareapplicativo:ccdc ]] | 2018 | module | moduledeps/gnu/ccdc | https://www.ccdc.cam.ac.uk/ | | | [[..:priv:cluster:softwareapplicativo: plumed]] | | module | | http://www.plumed.org/ | |
| | | [[.:priv:cluster:softwareapplicativo: mpi4py]] | | rpm ohpc | | | |
| | | [[..:cluster:softwareapplicativo:orca]] | 4.1.1 | /hpc/share | moduledeps/gnu7-openmpi3/orca | https://orcaforum.kofo.mpg.de | |
| | | [[..:priv:cluster:softwareapplicativo:ccdc]] | 2018 | module | moduledeps/gnu/ccdc | https://www.ccdc.cam.ac.uk/ | |
| | | [[..:priv:cluster:softwareapplicativo:flap]] | 2.2.1 | module | modulefiles/flap | http://www.moldiscovery.com/software/flap/ | |
| | | [[..:priv:cluster:softwareapplicativo:biki]] | 1.3.5 | module | moduledeps/gnu/biki | http://www.bikitech.com/ | |
| | | [[..:priv:cluster:softwareapplicativo:sybyl]] | 8.1 | module | modulefiles/sybyl | | |
