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| calcoloscientifico:folding_unipr [01/04/2020 17:11] – creata roberto.alfieri | calcoloscientifico:folding_unipr [08/04/2020 10:22] (versione attuale) – roberto.alfieri |
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| === folding@unipr === | |
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| L’Università di Parma partecipa al progetto folding@home per capire come funzionano le proteine del virus e quindi progettare terapie per fermarle. | |
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| | === L’Università di Parma dona ore di calcolo del proprio Data Center HPC al progetto Folding@home per capire come funzionano le proteine del Coronavirus e quindi progettare terapie per fermarle. === |
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| | Le proteine sono costituite da una catena lineare di sostanze chimiche chiamate amminoacidi che, in molti casi, si "piegano" (fold) spontaneamente in strutture compatte e funzionali. È il modo in cui i componenti di una proteina sono disposti e spostati che determinano la funzione della proteina. I virus hanno proteine che usano per sopprimere il nostro sistema immunitario e riprodursi. |
| | Il modo di ripiegarsi delle proteine può essere simulato al calcolatore, ma la simulazione richiede un tempo di calcolo enorme ed è per questo che il progetto Folding@home (https://foldingathome.org) utilizza la potenza di calcolo inutilizzata di migliaia di PC di proprietà di volontari, che hanno deciso di installare e di eseguire un apposito software sul proprio computer. |
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| Le proteine sono costituite da una catena lineare di sostanze chimiche chiamate amminoacidi che, in molti casi, si "piegano" (fold) spontaneamente in strutture compatte e funzionali. E’ il modo in cui i componenti di una proteina sono disposti e spostati che determinano la funzione della proteina. I virus hanno proteine che usano per sopprimere il nostro sistema immunitario e riprodursi. | |
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| Il modo di ripiegarsi delle proteine può essere simulato al calcolatore, ma la simulazione richiede un tempo di calcolo enorme ed è per questo che il progetto folding@home ( https://foldingathome.org/ ) utilizza la potenza di calcolo inutilizzata di migliaia di PC di proprietà di volontari, che hanno deciso di installare e di eseguire un apposito software sul proprio computer. | Il progetto Folding@home, nato negli Stati Uniti è costituito da un gruppo di laboratori di ricerca sparsi nel mondo che, utilizzando una serie di software che vengono implementati ad hoc, studia la comprensione dei meccanismi biochimici attraverso i quali si sviluppano certe patologie. In questo momento particolare il focus è appunto sullo studio dei meccanismi del Coronavirus. |
| | Negli ultimi giorni le installazioni hanno superato quota 400.000, per una potenza di calcolo complessiva di circa 474 PetaFLOPs, decisamente superiore al più potente calcolatore al mondo, che arriva a 150 PetaFLOPs (http://top500.org). |
| | L’Ateneo di Parma dispone di un Supercomputer per il calcolo ad alte prestazioni (HPC) a supporto della ricerca scientifica, gestito dalla U.O. Erogazione Servizi dei Sistemi Informativi (https://www.hpc.unipr.it). |
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| Negli ultimi giorni le installazioni hanno superato quota 400.000, per una potenza di calcolo complessiva di circa 474 PetaFLOPs, decisamente superiore al piu’ potente calcolatore al mondo che arriva a 150 PetaFlops (http://top500.org). | Da diversi giorni, 5 nodi del cluster HPC, per un totale di circa 300 core e 8 GPU, stanno contribuendo al progetto. |
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| L’Ateneo di Parma dispone di Supercomputer a supporto della ricerca scientifica ( https://www.hpc.unipr.it ) e da diversi giorni 8 nodi del calcolatore, per un totale di circa 300 core e 8 GPU, stanno contribuendo al progetto. | |
| | Parma, 1/4/2020 |
